在workstation上安装torque

yuinh2007

系统环境：Ubuntu 10.04 LTS x86_64

硬件环境：32cpu

目的：安装Torque 2.4.x

1. 解压源码包

tar xzf torque-2.4.6.tar.gz

2. 编译并安装至/usr/local/torque目录下,安装需要root权限

cd torque-2.4.6/

./configure --prefix=/usr/local/torque

make -j 8

sudo -s

make install

./torque.setup root

3. 配置环境，以计算机名Node1为例

gedit /etc/hosts

添加或修改

127.0.0.1 Node1 localhost

gedit /etc/profile

添加：

#Torque
export PATH=/usr/local/torque/bin:/usr/local/torque/sbinPATH

source /etc/profile
默认情况下，Torque的主目录在 /var/spool/torque下

因此，到该目录下进行其他环境变量的设置：

cd /var/spool/torque

vi server_priv/nodes

添加：

Node1 np=32

即计算机名和CPU数目

vi mom_priv/config

添加：

$pbs_server = 127.0.0.1

vi server_name

添加：

Node1

4. 启动client daemon

pbs_mom

5. 重启pbs server daemon

qterm

pbs_server

6. 启动scheduler daemon

pbs_sched

7. 检查服务是否正确启动

ps -aux | grep pbs #check all is running
qstat -q #check the presence of the queue
qmgr -c 'p s' #check server & queue settings
pbsnodes -a  #check if the nodes are listed and up

8. 配置列队

qmgr -c "set queue batch resources_default.walltime = 360:00:00"
qmgr -c "set server query_other_jobs = True"
qmgr -c "set queue batch resources_max.ncpus=32"

9. 测试列队

首先退出root

exit

source /etc/profile

echo "sleep 30" | qsub
qstat

10. 配置开启启动

cd到torque-2.4.6/contrib/init.d目录下

vi debian.pbs_mom

将DAEMON=/usr/local/sbin/$NAME改为DAEMON=/usr/local/torque/sbin/$NAME

相同的，修改 debian.pbs_sched和debian.pbs_server的DAEMON=/usr/local/sbin/$NAME为DAEMON=/usr/local/torque/sbin/$NAME

将这三个文件复制到/etc/init.d/目录下

sudo cp debian.pbs_mom /etc/init.d/pbs_mom

sudo cp debian.pbs_sched /etc/init.d/pbs_sched

sudo cp debian.pbs_server /etc/init.d/pbs_server

sudo update-rc.d pbs_server defaults

sudo update-rc.d pbs_mom defaults

sudo update-rc.d pbs_sched defaults

装得还是有点迷糊，不过好在这次成功了。

提交列队后：

mxio@Node1:~$ qstat
Job id                    Name             User            Time Use S Queue
------------------------- ---------------- --------------- -------- - -----
2.localhost               STDIN            mxio                   0 R batch  

补记：

让torque发送任务信息邮件

系统要求安装好sendmail

因此：

sudo apt-get install sendmail

sudo apt-get install mailutils

此时测试是否启动 ps aux |grep sendmail

显示：

root      1592  0.0  0.0  90476  2556 ?        Ss   16:39   0:00 sendmail: MTA: accepting connections         
mxio      2570  0.0  0.0   7628   956 pts/0    S+   16:49   0:00 grep --color=au
to sendmail
You have mail in /var/mail/mxio

测试是否可以正常发送邮件：

编写一般的邮件：

mail test@mail.com

显示：

Cc，抄送，跳过按enter

Subject: 输入内容，完成后按ctrl+D结束编辑发送

当目标邮箱接收到邮件后，说明配置正确。

如果之前没有配置sendmail，那么torque需要重新编译安装，正常顺序即可

编写PBS时添加：

#PBS -m abe -M test@mail.com

即可接收

其中：-m abe

a 是任务终止邮件 b是任务开始邮件 e是任务结束邮件，正常情况下，全开abe会接收到2封邮件

-M 是目标邮件地址

接收任务结束的邮件：

Torque Qmgr设置：

qmgr -c 'p s'  查看列队设置

qmgr -c 'set server xxx=xxx' 设置server列队参数

qmgr -c 'unset server xxx' 取消server xxx的设置

qmgr -c 'set server managers += mxio@Node1'

qmgr -c 'set server operators += mxio@Node1'  在"="号前加"+"表示附加条件，本例为添加mxio为管理员

qmgr create queue xxx 建立xxx列队

qmgr delete queue xxx 删除xxx列队

qmgr -c 'set server mail_from = mxio' 设置发送邮件人，这样发件人就是 mxio

下面设置 发送邮件的 domain，因为默认发送邮件的邮箱地址是 adm@localhost.domainname 这样邮件是不能回复的

进入 sendmail的设置环节，需要root身份：

su -

vi /etc/mail/submit.mc

将：dnl MASQUERADE_AS()dnl

改为：

MASQUERADE_AS(`126.com')dnl
其中126.com就是选用邮箱的地址 这样完整的发件人邮箱地址就是 ： mxio@126.com

注意的地方就是：上面两行括号里的点不是两个单引号. 而是一个 ` 和 一个单引号 '

保存

service sendmail restart

如此设置，提交列队如果请求发送邮件的话，那么发件人就是你设置的这个“虚假”的邮箱地址，但是它又真实存在，这样用户回发的邮件就可以回复到这个“虚假”的地址上，方便管理员查收邮件。

Sendmail发送很慢的问题

vi /etc/hosts 添加

127.0.0.1 localhost.localdomain localhost yourhostname

这样设置服务器别名，sendmail就绕过DNS查找主机名的A记录和反向域名记录，从而发送邮件就快了。